1、大多电子商务模式有互补性
不同的电子商务模式专注的优势领域是相异的，因此难免会在其他方面的能力上有所缺失。将不同的模式组合在一起，利用一种模式的优势弥补另外一种模式的弱势，增强抵抗市场风险的能力，增加创新的能力。如近日eBay与B2B公司环球资源建立战略联盟关系，拟联合推出一种双赢的模式—环球通，帮助eBay在全球范围内的大卖家获取更多的高性价比的货源信息，并为环球资源的供应商提供广阔的C2C市场销售渠道。这种组合形成了有机完整的电子商务产业链，也弥补了B2B、B2C与C2C等电子商务模式的不足，创造了一种新的B2X2C模式1。
2、电子商务模式的组合可提高企业的综合竞争优势
综合各模式在在不同领域内的优势，形成一个更有竞争力的电子商务模式，比使用单一电子商务模式的企业有更强的适应性。
3、电子商务模式组合可开拓新的收入来源
不同的电子商务模式有不同的收入来源，将模式合理的组合在一起，企业能获得更多种类的收入来源，或者有增加原有收入的促进性作用。
从价值链的角度看，各种模式发挥作用的价值活动是不一样的。有的模式是作用在采购活动中的，如直接采购；有的模式是作用在企业的基础设施上的，如公共交易平台和价值网集成者；有的是作用在生产过程中的，如内容提供商；有的是作用在销售活动中的，如直接面向顾客、全服务提供商、整体企业和中介；有的模式是作用在服务活动中的，如虚拟社区。将没有冲突的各个价值活动上的电子商务模式组合在一起，可以提高整条价值链的集成性、高效性和增值。
不同的电子商务模式各有特点和优势，在组合电子商务模式时企业需要充分利用模式之间的互补性，将互补的模式组合在一起发挥促进性的作用。避免将互斥的模式组合，以免发生冲突，造成企业电子商务应用的失败。如Amazon采用直接面向顾客和虚拟社区的模式组合取得了电子商务上突破性的成功。它直接与顾客联系，利用互联网向顾客直接销售商品，省去分销的中间环节，同时利用虚拟社区，让顾客可以提供对商品的评价，供其他顾客参考，刺激和帮助更多顾客的理性购买活动。再如Dell在电子商务应用上组合了直接面向供应商、价值网集成者和直接面向顾客等模式发展成全球最大的个人电脑生产商。Dell利用直接面向供应商向电脑的零配件供应商直接购买零配件，利用直接面向顾客为最终顾客提供个性化配置的电脑，而在整条价值链中以价值网集成者的模式协调链的运作。
不同电子商务模式之间的组合有一定的规律可以遵循。但是无论模式之间如何组合，不能给电子商务应用带来冲突，冲突的模式组合只能让组合后的电子商务应用中遇到相互抵触而无法开展。组合的规律主要是根据各个电子商务模式作用的不同价值活动的类别以及模式之间的内在关系来决定模式实际可行的组合。